建文四年（1402年）农历六月十三日，朱棣率军闯入南京城，紧随其后，建文帝朱允炆的皇宫发生了悲剧，朱允炆举家自焚以示绝望。四天后的一个清晨，朱棣正式登基，成为了明朝的第三任皇帝——永乐皇帝。

永乐皇帝上任后，迅速改变了建文帝时期的一些政策，尤其是对藩王及其弟弟们的态度，他决定重新与他们建立和睦的关系，给他们更多的优待和关注。永乐帝首先对被建文帝剥夺王位的五位弟弟进行了平反，恢复了他们的待遇，让他们回到父亲朱元璋生前对他们的安排，尽管没有明确调查这些弟弟们是否犯有罪行。毕竟，永乐帝自己的皇位也并非正当继承，而是通过夺取侄子朱允炆的帝位得来的。

在所有被召见的藩王中，永乐皇帝最先召见的是他在外地的六弟——楚王朱桢。因为朱桢的五弟周王朱橚此时已经被软禁在南京，且被关押已有四年。朱桢是继周王之后年纪第二大的弟弟，得知自己被召见后，他毫不拖延，立刻从武昌启程，迅速赶到南京，并与已成为皇帝的四哥朱棣见面。根据父亲朱元璋的规定，弟弟们在称呼皇帝时必须称之为“大兄皇帝”，无论对方是实际的大哥还是四哥。

永乐皇帝并没有因朱桢在靖难之役中未曾给予自己帮助而责怪他。兄弟多年未见，皇帝热情地宴请了朱桢，并在酒席间向他详细叙述了靖难的经过。朱桢听后，立刻表示建文帝的削藩行为是错误的，严重违背了祖训，使得国家和家庭陷入动荡，而现在一切皆因他自作自受。同时，朱桢也赞同四哥的登基，认为这符合天命，且获得了全家上下的支持。几天后，朱桢带着四哥赏赐的二万五千锭宝钞和其他赠品，愉快地返回了武昌。此后，永乐皇帝陆续召见了其他外地的藩王和王子，并给予了他们丰厚的奖赏。永乐初年，王爷们纷纷前来南京朝拜，成群的王子和王爷们络绎不绝。

朱桢的表态得到了永乐皇帝的高度赞赏，皇帝心中早有一番计划，对奖惩的分寸把握得十分精准。永乐元年（1403年）四月，楚王朱桢向大兄皇帝提出希望朝廷安排工部修缮自己的王府。永乐皇帝没有拒绝，但指出当前国家战乱刚刚平息，民生困难，且自然灾害频发，暂时无法满足他的要求。他告诉朱桢，如果他急需修缮，可以自行先做，等时机成熟后，皇帝会派专人前来好好修整王府。

到了永乐三年（1405年）六月，湖广都指挥司向永乐皇帝报告，表示楚王府自制了一块铁牌，用于进出武昌城。永乐皇帝对此表示不满，指出这违反了祖制，所有的王府进出城门都必须由都司衙门管理，而不是由王府自行决定。虽然楚王在湖广一带权势赫赫，但依然必须遵循朝廷的规矩。

朱桢是一位极具才华的藩王，从洪武十五年（1382年）到洪武三十年（1397年），他曾六次担任主帅，参与了湖广、贵州、云南等地的战斗，且战无不胜。在永乐帝在位期间（1402年-1424年），朱桢在武昌的表现稳定，除了几次前往京师与永乐帝见面外，他并未参与任何军事行动，也没有制造什么大麻烦。

朱桢在武昌度过了43年的平静岁月，直到永乐二十二年（1424年）三月去世，享年五十多岁，且比永乐皇帝早去世四个月。在这二十多年中，永乐皇帝对朱桢的关照不遗余力，时常送去金银财宝、牛羊酒茶，还有绫罗绸缎，甚至曾派人送上郑和下西洋带回来的西洋布匹。面对四哥的厚重恩情，朱桢在心中一直深藏自己的雄心壮志，最终将这些才华带入了土中。

永乐皇帝对朱桢的表现非常满意，认为他是一位典范的闭门藩王。朱桢没有野心，不干涉政事，守规矩，为其他藩王树立了一个良好的榜样。朱桢去世后，永乐皇帝对他做出了高度评价，称其为一位优秀的王爷。尽管帝王之家难免充满权谋斗争，但兄弟间的亲情依然存在。

时光流转，崇祯十六年（1643年）春，张献忠的农民起义军攻占了武昌。楚王朱华奎被俘，并被关进铁笼沉入长江。起义军还对楚王宗室展开了大规模的屠杀，朱桢的后代几乎被杀尽。